米国Eurofins Genomicsは、Express Oxfordナノポアシークエンサーを用いたwhole plasmid sequence サービスを開始しました
ユーロフィンバイオファーマサービスの「ニュースレター（2023年6月号）」が発行されました。
ユーロフィングループは、食品・製品・環境・アグロ・ジェノミクス・クリニカルダイアグノスティック・医薬品・材料等、幅広い分野に関わる分析及び検査サービスをグローバルに展開しています。
世界61カ国に900以上のグループラボがあり、グループ法人数は1,000社を超え、200,000通りに及ぶ分析項目・手法を採用、年間4億5,000万件を超える試験を実施しています（2023年3月現在）。
医薬品分析は、ユーロフィンバイオファーマサービスが担当しています。日本国内においては、当社「ユーロフィン分析科学研究所（E-ASL）」が受託を行っています。一部のサービスは、当社ラボが海外ラボとの仲介となり受託しています。
バイオファーマサービスでは、お客様に最新情報をお届けするため、定期的にニュースレターを発行しています。
2023年6月号では、以下6つの技術情報を紹介しています。
- 体外受精時の胚の遺伝子異常の特定
- 定量的な容器完全性試験－必須なテクニックをナビゲート
- Eurofins BPT グローバル評議会は相互協力により、お客様により良いサービスをご提供
- 米国Eurofins Genomicsは、Express Oxfordナノポアシークエンサーを用いたwhole plasmid sequence サービスを開始しました
- 新しい固体形態を発見するためのハイスループットスクリーニング
- Eurofins BioPharma Product Testingは中国に新しい施設を開設
本技術コラムでは、「米国Eurofins Genomicsは、Express Oxfordナノポアシークエンサーを用いたwhole plasmid sequence サービスを開始しました」を紹介します。
国内のユーロフィンジェノミクスでも、whole plasmid sequence（プラスミド丸読み）サービスを開始しました。
サービスの概要、特徴、サービスタイプ・価格・納期等の詳細は、下記のページをご覧ください。
米国Eurofins Genomicsは、低コストでサンプルがラボに到着したその日に結果がわかる、whole plasmid sequenceサービスを開始しました。
Gen3次世代シークエンシング（NGS：Next Generation Sequencing）テクノロジーを活用することで、最大99%の精度を実現しています。
米国Eurofins Genomicsは、ケンタッキー州ルーイビルに大規模な設備を持った、NGS受託サービスにおける重要なグローバルプレーヤーです。NGSによる解析は、昨今、サンガー法シークエンシングの領域を脅かす大きな存在となっています。
今回、新たに開始したwhole plasmid sequenceサービスは、ロングリードシークエンシングのために手頃な価格で迅速なソリューションを提供することで、これまでのサンガー法によるシーケンスとNGSのギャップを埋めようとしています。
NGSシークエンシングの長所と短所
次世代シークエンシング（NGS）が昨今の研究に及ぼした影響の大きさは言葉では表せないほど大きなものです。
ディープシークエンシングは、個別化医療および感染症、遺伝性疾患、がんの進化的研究への道を開きました。
しかし、従来のNGSシークエンシングの受託サービスは、比較的時間がかかり、また、消耗品や装置のコストが時間経過とともに急激に安価になっているにもかかわらず、かなりコストがかるものとなっていました。
また、その結果を分析し解釈するのにも、多くの時間と労力を要します。
NGSは、新たな可能性の世界を開きましたが、多くの研究室は、この新しいテクノロジーを効果的に使用するためのリソースや予算がほとんどなく、NGSはルーチン的なシークエンシングのニーズから解離したままとなっています。
サンガー法シークエンシングの長所と短所
一般に、「ショートリード」または1分子シークエンシングと呼ばれるサンガー法は、依然として99%の精度を有するシークエンシングのゴールドスタンダードです。
結果も非常に迅速に得られます。しかし、サンガー法は1度に1つのDNA断片しかシークエンスしないため、長いプラスミドを確認するためには非常に手間がかかります。また、新しい技術のような奥深さや汎用性はありません。
whole plasmid sequence
サンガー法とNGSはどちらも長所と短所があり、多くの研究者がその時の必要性に応じてそれぞれのシーケンスサービスを選択しています。
Whole plasmid sequenceは、両方の長所を組み合わせたものです。Gen3 NGSテクノロジーと社内で開発した方法を融合させることで、手ごろな価格で迅速なロングリードシークエンシングを提供できます。
北米のUPS拠点に隣接する米国Eurofins Genomicsは、物流上の利点を生かし、サンプルが到着したその日に結果をデータで返却することができます。
プライマーやライブラリーを準備する必要もなく、2.5～300 kbの長いコンストラクトを読むことができます。
Eurofins Genomicsは、Gen3 NGSテクノロジーと物流上の利点を活かし、従来のNGSの何分の一かの時間とコストで、シークエンシングの新しい可能性の世界を開きます。
さらに詳しい情報は、こちらをご覧ください。
原文は、Eurofins Genomics US launches Express Oxford Nanopore Sequencing service with same-day resultsをご覧ください。
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