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デジタルPCR ~ 変異解析 ~

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デジタルPCRを用いた変異型遺伝子を高感度に検出するサービスをご提案致します。リキッドバイオプシーサンプルや原発巣・転移巣のFFPEサンプル中などに含まれるがん遺伝子や、がん抑制遺伝子の変異を解析することで、がん研究をサポートします。

 

サービスの特長

  • 0.005-0.1%のレアミューテーションの検出が可能です(BRAF V600Eの検出では0.001%オーダー)
  • PCR効率によるバイアスがなく、より正確な解析が可能です
  • 2チャネル(FAM、HEXまたはVIC)で構成されており、同一反応内で野生型と変異型の割合の算出が可能です

 

このようなお客様にお勧めします

  • がん研究に
  • 治療耐性のモニタリングに

 

サービス基本仕様

DNA抽出→濃度測定・品質評価→デジタルPCR解析→変異型遺伝子の定量または野生型遺伝子に対する割合の算出

1. DNA抽出
2. 品質評価
3. デジタルPCR
4. 変異型遺伝子検出/変異比率算出

※FFPEサンプルの場合、HE標本作製の病理医評価に基づく腫瘍領域のマクロダイセクションも実施できます

*条件検討からの実施でカスタムのプライマー・プローブも使用可能です

 

解析フロー

解析フロー

* こちらから、BIO RAD Laboratories, Inc.で合成・検証したプライマー・プローブのカタログをご確認いただけます。
** 市販DNA・合成遺伝子等を使用し数 wellでの検出確認、またはいくつかの濃度条件(7点前後)を振った検出限界の確認を行います。 *** 温度条件を8点設定し至適条件の検討を行います。 **** 濃度条件を数点(7点前後)振り、検出限界の検討を行います。 → 上記のアッセイワーク確認または至適条件検討後に実測検体の測定を行います。

 

受け入れサンプル

  • 全血(EDTA採血管など)
  • 血清、血漿
  • 組織、細胞
  • FFPEブロック
  • 未染スライド
  • DNA
  ※上記基準に満たない場合、その他サンプル性状の場合はお問い合わせください
  ※サンプル準備~ご発送手順ページもご覧ください

 

報告書内容見本

報告書内容見本

DNA変異解析 2Dプロット例

DNA変異解析 2Dプロット例 (野生型(Wild type)と変異型(Mutation)、2種類の蛍光標識を検出し、ドロップレット毎にプロットした図表です)

 

アニーリング温度の検討結果例

アニーリング温度の検討結果例

 

検出限界の検討結果例

検出限界の検討結果例

 

基本納品物

  • 試験報告書
  • 解析データ(CD-R / DVD-R)

 

納期

  • ターゲットプライマープローブ調達:2週間~
  • (予備検討試験):10営業日~
  • 解析:15営業日~

 

オプションサービス

 

関連するアプリケーション

 

申込書/注意事項のダウンロード

申込書等ダウンロードサービスページをご利用ください。

 

ご注文について

ご注文方法は、事前に試験仕様等のお打ち合せをさせていただいたうえで、ご案内させていただきます。まずはお気軽にお問い合わせください。

 

以下の情報をご提供いただけると、お見積のご案内がスムーズです。(未定の項目があっても構いません)

<ご提供いただきたい情報>

    • ご希望のサービス名(例:デジタルPCR ~ 変異解析 ~)
    • 生物種
    • サンプル性状(全血、血清、血漿、FFPEブロック、未染スライド、DNAなど)
    • サンプル数
    • ターゲット遺伝子名、変異領域
    • 解析区分:変異型遺伝子検出 / 変異比率算出
    • プライマー・プローブご提供有無
    • ※FFPE由来または受け入れサンプル基準に満たないサンプルの場合は併せてお問い合わせください。

 

 

 

お問い合わせ

ユーロフィンジェネティックラボ株式会社
電話番号 011-644-7342
営業時間 9時~17時(土日祝日除く)